AlphaGenome

模型与发布

Google DeepMind 2025-06 发布，输入 1 Mb，预测人 5,930 轨、小鼠 1,128 轨，覆盖 11 种模态 [1]。

训练数据配方

• 公共库：ENCODE、GTEx、4D Nucleome、FANTOM5 等高通量功能基因组测定（数据源名称来自模型卡，二手）[2]。这类模型"真值即预训练数据"，不存在蒸馏稀释。
• 蒸馏合成：4 折交叉验证训练全折教师集成，再蒸馏出单一学生模型 [1]。
• 私有真值：无。

数据供应方与许可

公共功能基因组联盟。权重需接受非商用条款，推荐 H100（二手）[2]。

已知问题与口径冲突

发布的训练集因许可剔除了 GTEx 组织数据（见 GTEx 与 TCGA）。基准胜负数各媒体口径不一（46/50 与 22/24 加 24/26），以论文为准。

来源

1. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.06.25.661532v1.full (2026-10-15)
2. https://huggingface.co/google/alphagenome-all-folds (2026-10-15)