Cambridge Structural Database (CSD)

数据集英国数据库

CCDC 维护的小分子与金属有机晶体结构库,超 140 万条

数据类型
小分子晶体结构;有机与金属有机分子三维几何
规模口径
1,431,347 条结构、1,274,034 个不同化合物(2026-01-01 CCDC 统计);约 45.8% 为有机物
License
商业订阅(CCDC)
链接
www.ccdc.cam.ac.uk

内容与规模

CSD 收录经实验测定的小分子晶体结构(X 射线与中子衍射),是小分子真实三维几何、键长键角与分子间作用的参考库。2026-01-01 统计共 1,431,347 条结构,较 2025-01 的 1,362,809 条增加约 6.9 万条(按两表相减推算);2025 年新增约 5.86 万条,该数字当时尚不完整 [1][2]。

格式与 license

由非营利机构 CCDC 维护,全库及分析软件按订阅授权,非免费公共库;单条结构可通过 CCDC 的结构访问服务获取。具体授权条款未逐条核 ⚠️。

哪些模型拿它训练或评测

药物化学软件(对接、构象分析、晶型预测)常以其几何统计作先验。公开材料未见主流蛋白或生物基础模型披露以 CSD 全库训练,⚠️ 未核。

已知偏差

偏向易结晶的小分子与金属有机体系;晶体态构象不等于溶液或蛋白结合态构象;全库不可自由再分发,限制开放训练集构建。

来源

  1. https://www.ccdc.cam.ac.uk/media/CSD-Entries-Summary-Statistics-2026.pdf (2026-10-15)
  2. https://www.ccdc.cam.ac.uk/media/CSD-Publication-Year-Statistics-2026.pdf (2026-10-15)

卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。