Electron Microscopy Data Bank
EMBL-EBI 维护的冷冻电镜密度图档案，2025 年单年发布首破 1 万条
- 数据类型
- 冷冻电镜密度图
- 规模口径
- 59,904 条 map（2026-07）
- 链接
- www.ebi.ac.uk
内容与规模
EMDB 存放 冷冻电镜、电子断层扫描等产生的三维密度图，由 EMBL-EBI 运营，始于 2002 年。2025 年首次单年发布 >10,000 条（统计口径之一为 11,692 条），累计 >50,000 条；2026-07 页面显示 59,904 条 map [1][2][3]。与原子模型档案 Protein Data Bank (wwPDB) 互补：EMDB 存密度图，模型在 PDB。
格式与 license
按 wwPDB/EMDB 体系公开提供；具体许可条款未逐条核。
哪些模型拿它训练或评测
结构预测模型通常通过 PDB 中的 EM 条目间接使用，EM 占当年 PDB 新发布比例已达 40.9%（2025）。未核到直接以密度图为输入的模型。
已知偏差与泄漏
冷冻电镜偏向大型复合物与可纯化的稳定样本；密度图分辨率差异大，局部分辨率低的区域模型可信度弱。图与模型的存放口径不同（deposit 与 release），年度统计易混。
来源
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卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”；⚠️ 为未经独立核实。