ESMFold2

内容与发布

ESMFold2 是 Biohub 在 2026 年与 ESM-C 语言模型（约 28 亿序列训练，二手）及 ESM Atlas 一并发布的结构预测与设计引擎，是 2022 年 ESMFold 的升级；EvolutionaryScale 已于 2025-11 并入 Biohub EvolutionaryScale Chan Zuckerberg Biohub ESM-2 / ESMFold。发布日期存在 05-27 与 06-09 两种说法，⚠️ 以 Biohub 公告为准 [1][2]。

性能与口径

二手报道称：单序列抗体-抗原复合物 55%、蛋白-蛋白复合物 71%（含 MSA 77%）；ESMFold2-Fast 预测 1024 残基约 9.4 秒；对 EGFR、PD-L1 等五个靶点的 binder 设计，高推理算力下小 binder 命中率约 70%、scFv 约 21%。这些数字来自第三方转述，未回源到预印本，⚠️ 勿直接引用 [2]。

使用场景

Anthropic 蛋白 binder 实验 用 ESMFold2 与 ESMFold2-Fast 作排序器，与其他公开共折叠预测器共同重评分；站内分析引述其三模型集成 AP 0.66 高于 AF3 的 0.55，同时指出共折叠分数对亲和力预测较弱（ρ 约 0.16–0.25）。训练数据与蒸馏规模未查到公开细节。

来源

1. RosettaCommons 转载 Biohub 发布 2026-06-09 (2026-10-15)
2. Tamarind 博客 ESMFold2 与 ESM-C (2026-10-15)