Human Cell Atlas
国际单细胞图谱联盟及其数据门户,规模为二手口径
- 数据类型
- 单细胞图谱
- 规模口径
- 约 6,200 万细胞 / 9,100 位供者(二手,2025-01)
- 链接
- data.humancellatlas.org
内容与规模
HCA 是 2016 年启动的国际联盟,目标是绘制人体所有细胞类型,数据通过 Data Portal 提供。二手口径:2025-01 更新含约 6,200 万细胞、9,100 位供者;官方页未给精确数字 ⚠️ [1][2]。
格式与 license
数据由各贡献实验室提交,门户做统一元数据;许可条款未查到,部分数据同时出现在 CZ CELLxGENE Discover / Census 中。
哪些模型拿它训练或评测
未核到明确声明以 HCA 门户为训练语料的模型;其数据主要经 CZ CELLxGENE Discover / Census 等再处理库间接进入 scGPT 一类单细胞基础模型的预训练。
已知偏差与泄漏
供者数量虽多,但组织覆盖不均,偏向易获取的血液和免疫组织;同一数据在 HCA 门户、CELLxGENE 和 GEO 中多处存在,跨库合并时去重不严会造成评测泄漏,见 数据泄漏(训练-测试泄漏)。HCA 提供的是正常/参考细胞,缺少扰动标签。
来源
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卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。