InterPro

内容与规模

InterPro 把 Pfam、PROSITE、CDD 等成员库的预测签名合并为统一条目，并映射到 UniProt 序列。API 实测当前 InterPro 条目数为 54,922 [1]；注释的蛋白数与最新版本号未逐项核。

格式与 license

提供网页、REST API 与整库下载（XML/TSV）。条款未逐条核 ⚠️。

哪些模型拿它训练或评测

ESM3 把功能注释（含 InterPro 来源的标签）作为训练输入的一部分（见 ESM3，二手，未回原论文复核）；蛋白功能预测与结构域识别方法常用其作标签和评测（见 UniProt）。

已知偏差

标注依赖成员库签名，对未表征、远缘同源蛋白覆盖弱；功能为推断而非实验验证；热门家族条目密集。训练与评测若同用 InterPro，需注意按家族切分以避免泄漏，见 数据泄漏（训练-测试泄漏）。

来源

1. https://www.ebi.ac.uk/interpro/api/entry/interpro/ (2026-10-15)