cz-benchmarks

内容与规模

Biohub/CZI 与 NVIDIA 共建的开源 Python 包，2025-10 宣布。初版含 6 个单细胞任务：聚类、细胞类型分类、跨物种整合、扰动表达预测、序贯排序、跨物种疾病标签迁移，每任务多指标；计划加入留出评测集、影像与变异效应预测 [1][2]。

真值来源与是否盲测

评测基于既有标注数据（如来自 CZ CELLxGENE Discover / Census 一类公共数据），属回顾式；留出集尚在计划中，当前不是盲测。

谁用它发布结果、运营方角色

面向虚拟细胞模型开发者的公共评测工具，运营方为慈善基金会（Chan Zuckerberg Biohub），同时也是相关数据与模型的提供方，评测方与参评生态有利益关联。

缺陷

任务偏标准化的单细胞分析，对扰动预测的可靠性仍受线性基线问题影响（见 PerturBench）；采用度与第三方复现结果未核到。

来源

1. https://biohub.org/?p=36696 (2026-10-15)
2. https://www.rdworldonline.com/czi-and-nvidia-expand-virtual-cell-push-with-open-models-and-benchmarks/ (2026-10-15)