gnomAD
Broad 牵头的群体外显子与基因组变异频率库,v4 约 80 万人
- 数据类型
- 群体变异等位基因频率;基因约束度;结构变异
- 规模口径
- v4.1 约 807,162 人,含 730,947 外显子、76,215 全基因组(UCSC/AWS 登记口径,二手)
- License
- 摘要数据无使用限制(AWS 登记口径),具体条款未核 ⚠️
- 链接
- gnomad.broadinstitute.org
内容与规模
gnomAD(Genome Aggregation Database)汇总多个测序队列的去标识化变异频率,提供基因约束度、LOFTEE 注释等。最新公告为 v4.1.1(2026-03-30),更新约束度指标与 LOFTEE 标记 [1]。v4.0 公告称含 807,162 人;论坛口径为 807,103,两者略有差异 [1]。
格式与 license
网页浏览器与 Hail 表、VCF 整库下载,AWS 开放数据登记为无使用限制的汇总数据 [2];访问和再分发条款以官网政策页为准,未核 ⚠️。仅含汇总,不含个体级数据。
哪些模型拿它训练或评测
变异致病性预测与基因约束模型把群体频率作为"进化选择"信号,常与 ClinVar 联用(二手,未逐篇核)。
已知偏差
参与者以欧洲血统为主,其他群体代表性不足;病例队列与对照混合,不能当作"健康"基线;外显子队列对非编码区覆盖弱。
来源
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卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。