PubMed / PMC

数据集美国数据库

NLM 的生物医学文献索引与全文库,约 4,100 万条

数据类型
文献题录与摘要;开放获取全文;MeSH 标注
规模口径
PubMed 约 4,128 万条记录;PMC 全文约 1,270 万篇,其中开放获取约 831 万篇(E-utilities 实测,2026-10-15);2025 年发表日期记录约 188 万条
License
题录公开;全文按各文章许可,仅部分可再分发
链接
pubmed.ncbi.nlm.nih.gov;pmc.ncbi.nlm.nih.gov

内容与规模

PubMed 是生物医学文献的权威索引,PMC 提供全文存档。E-utilities 实测:PubMed 约 4,128 万条记录,PMC 约 1,270 万篇全文,开放获取约 831 万篇 [1]。

格式与 license

提供网站、E-utilities 与年度 baseline XML 整库下载。摘要版权归出版商,NLM 允许下载元数据;PMC 开放获取子集中,只有带可再分发许可(如 CC 系)的文章才能用于批量再利用,需分子集核对 ⚠️。

哪些模型拿它训练或评测

PubMed 摘要与 PMC 开放获取全文是生物医学语言模型的主要语料,如 BioGPT 使用 PubMed 摘要(本次未逐一核实各模型语料规模);也是文献问答与 agent 评测的数据来源。

已知偏差

偏向英语与发表成功的正结果,负结果稀缺(见 阴性数据);年份越近的论文越可能在模型评测集内,造成污染,见 数据泄漏(训练-测试泄漏);摘要缺少方法细节,全文仅部分可用。

来源

  1. https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi (2026-10-15)

卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。