阴性数据

定义

阴性数据指设计或化合物经实验测定后"没有结合/没有活性"的结果。模型训练与评测需要它来校准假阳性，但文献与数据库倾向只收阳性。

证据

系统公开阴性的先例很少：Proteinbase 收录含阴性的实验蛋白设计（统一协议；官网"+3000 个已验证蛋白"；BoltzGen 1,752 生成/532 测，RFdiffusion 1,592/164，BindCraft 600/177）[1][2]；CACHE Challenges 公开全部测定结果 [3]。Anthropic 蛋白 binder 实验 据二手转述公开了含失败靶点的结果，待复核 ⚠️。Proteinbase 的不同规模数字口径不同（提交/测定/阳性），不可混用。其余公开语料缺失阴性的情形，具体统计未查到。

争议

平台独占路线把失败数据当护城河，如 Periodic Labs 的"竞争对手爬不到"叙事；公开派与独占派的取舍尚无共识。

来源

1. https://www.adaptyvbio.com (2026-10-15)
2. https://www.proteinbase.com (2026-10-15)
3. https://www.cache-challenge.org (2026-10-15)