RoseTTAFold All-Atom

论文与基准美国配方

PDB 全装配体加约 10 倍 AF2 预测,Science 2024

数据类型
蛋白-小分子-核酸复合物结构

模型与发布

Baker 组(IPD)2024-03 发表于 Science,是 RoseTTAFold 的全原子版本,也是 RFdiffusion / RFdiffusion2 系列的结构骨架 [1]。

训练数据配方

  • 公共库:Protein Data Bank (wwPDB) 全生物装配体。
  • 蒸馏合成:另加约 10 倍于 PDB 规模的 AF2 预测模型(对 UniRef50 的预测;博客转述约 30 万 PDB 结构,约 1:10,二手)[1][2]。
  • 私有真值:无。

数据供应方与许可

wwPDB;AF2 预测见 AlphaFold2。

已知问题与口径冲突

PDB 截止日期与是否使用 CSD 未查到;1:10 比例为二手转述,⚠️ 待复核。

来源

  1. https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.mcvdnck6v (2026-10-15)
  2. https://arxiv.org/pdf/2502.19173 (2026-10-15)

卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。