Tox21 / ToxCast

数据集美国数据库

美国多机构高通量体外毒理库,Tox21 约 1 万种化学品

数据类型
高通量体外毒理筛选;核受体与应激通路报告基因
规模口径
Tox21 10K 库约 1 万种化学品(约 1/3 药物、2/3 环境化学品);一项分析为 70 个细胞实验、213 个读出
License
公开发布,许可条款未逐条核 ⚠️
链接
tripod.nih.gov;comptox.epa.gov

内容与规模

Tox21 由美国多个联邦机构合作,用 qHTS 把约 1 万种化学品跑过大量细胞实验,终点集中在核受体信号与应激反应,另有基因毒性、发育毒性、细胞死亡等小类 [1][3]。EPA 的 ToxCast 提供互补的体外终点,结果经 CompTox Dashboard、PubChem 等公开发布(二手)。

格式与 license

以表格化活性数据发布,可从 PubChem 与 EPA 下载;许可条款未逐条核 ⚠️。

哪些模型拿它训练或评测

MoleculeNet 收录 Tox21 子集作毒性分类基准;2014–15 Tox21 数据挑战赛由 DeepTox 夺冠(站内页面"类器官/器官芯片/AI 毒理")。同页指出:模型在历史数据上准确率可超 85%,但前瞻验证很有限。

已知偏差

体外细胞读出与人体毒性之间有外推缺口;化合物以易溶、易筛的工业与药物分子为主;荧光/荧光素酶干扰与细胞毒性会造成假阳性。监管转向 NAMs 的背景见 FDA Modernization Act 2.0/3.0 与 FDA NAMs 路线图。

来源

  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7931954/ (2026-10-15)
  2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4092345/ (2026-10-15)
  3. https://catalog.data.gov/dataset/the-tox21-10k-compound-library-part-1-collaborative-chemistry-advancing-toxicology (2026-10-15)

卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。