VirtualFlow

原理：Gorgulla 等（Nature 2020）的开源平台，对超大化合物库做对接筛选；公开 >14 亿分子的 ready-to-dock 库。HMS 称 1 万核集群约两周可筛 10 亿 [1][2]。

代表实现与用户：筛超过 10 亿化合物，发现 KEAP1 抑制剂 iKeap1（Kd 114 nM）[1]。VirtualFlow 2.0 预印本接入 Enamine REAL Space 690 亿分子，并加入自适应方法降低成本 [4]。同类大库对接工作：Lyu 等（Nature 2019）对 1.7 亿按需合成化合物对接，D4 实测 549 个、AmpC 实测 44 个，得 81 个新化学型，30 个亚微摩，D4 命中率随对接分数近单调下降，最高分段约 25%、最低分段 0% [3]。

局限：对接分数是富集过滤器，不是亲和力真值，用其作标签训练的模型继承系统误差。算力美元成本论文与新闻稿未给。

来源

1. https://www.fu-berlin.de/en/presse/informationen/fup/2020/fup_20_071-virtual-flow/index.html (2026-10-15)
2. https://drugtargetreview.com/?p=57493 (2026-10-15)
3. https://enamine.net/publications/1029-ultra-large-library-docking-for-discovering-new-chemotypes (2026-10-15)
4. https://www.biorxiv.org/node/3118097 (2026-10-15)