sim2real 保真度阶梯
概念与方法仿真
仿真可信度沿结构、姿态、亲和力、细胞、疗效逐级放大衰减
定义:仿真与合成数据的保真度越往下游(结构 > 姿态 > 亲和力 > 细胞功能 > 疗效)越差,误差逐级放大,因此需要湿实验真值在末端校准。
证据:结构层可用,蒸馏已是标准配方(见 AlphaFold DB 与结构蒸馏,[1][2])。姿态层,PoseBusters(Chem. Sci. 2024)显示 5 个深度对接方法未在物理合理性或泛化上超过 AutoDock Vina 与 CCDC Gold [5]。亲和力层,Boltz-2 在 FEP+ 基准 Pearson 0.62 且为开发者自报,⚠️ 未见独立复核 [2]。细胞层,Nature Methods 2025 比较 5 个基础模型与 2 个深度模型,对单/双基因扰动预测无一超过"无效应"与"加性"基线 [3]。疗效层只有 EMA 对 PROCOVA 的资格意见这一监管先例,预测被当协变量而非替代终点(见 Unlearn.AI)[4]。
争议:框架是分类法,各级放大系数缺乏统一度量;对接分数偏差与基准泄漏会抬高表观精度。
来源
- https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.01.600583v1.full (2026-10-15)
- https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.06.14.659707v1.full (2026-10-15)
- https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12328236/ (2026-10-15)
- https://www.clinicaltrialsarena.com/news/ema-qualifies-unlearn-approach/ (2026-10-15)
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10901501/ (2026-10-15)
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卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。