Adaptyv 蛋白设计竞赛

内容与规模

2024 年 EGFR 竞赛共两轮，累计 1,800+ 设计提交，601 个蛋白被表达并测亲和力 [1]。R1 命中率 2.5%（5/201），R2 约 13–14%（53/378）；冠军 Cradle 达 1.21 nM，较 cetuximab 强约 8.2 倍 [1][2]。2026-09 至 2026-12 的 Anthropic × Adaptyv 竞赛预计测试 5,000+ 蛋白 [3]。

真值来源与公开程度

测定由 Adaptyv Bio 自有实验室完成，结果公开发布，并进入 Proteinbase（含阴性结果）。2026 年赛事无现金奖金，据二手报道由赞助方提供 Claude 额度与算力、Twist 供 DNA，待复核 ⚠️。

谁拿去训练

参赛者在 R1 公开数据后改进 R2 设计，是"回流改进设计"的直接证据，但与参赛者看到公开数据的混杂因素无法分离 [1]。

已知缺陷

命中率高度依赖靶点，不可跨靶比较 [2]。两轮提升约 5 倍混杂了参赛者经验积累。与 Anthropic 蛋白 binder 实验 共用同一验证渠道。

来源

1. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.04.17.648362.full.pdf (2026-10-15)
2. https://adaptyvbio.substack.com/p/protein-design-competition-results (2026-10-15)
3. https://www.proteinbase.com (2026-10-15)