Proteinbase

数据集瑞士基准

Adaptyv 运营的开放实测蛋白库,含计算预测与阴性结果

内容与规模

2025-10 上线,起步 1,000+ 个新设计蛋白,均由 Adaptyv Bio 实验室按标准协议测定,附计算预测与设计方法,结构经 Boltz-2 预测流水线标注,许可 ODC-BY [1]。公司口径:Nipah 竞赛 1,200 个蛋白、99 个新 binder、26 个达单位数纳摩尔或更优(二手转述)⚠️ [1]。

真值来源与是否盲测

真值为 Adaptyv 自家实验室实测;竞赛式数据在设计提交后测定,评测集事先不公开,但未见预注册或第三方复测。

谁用它发布结果、运营方是否同时是服务商

运营方同时是出实验的服务商,数据库、基准(BenchBB)、竞赛(Adaptyv 蛋白设计竞赛)同出一源。其明确以收集含阴性结果的数据为目的,见 阴性数据。

口径与缺陷 ⚠️

"1,000+"为上线时规模,现行条目数未核到,不写具体数字;单实验室系统误差、被测集合并非随机样本,是使用时的主要局限。

来源

  1. https://www.biopole.ch/?p=12847 (2026-10-15,二手转述)
  2. https://adaptyvbio.substack.com/p/introducing-benchbb-and-the-community (2026-10-15)

卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。