Arc State

论文与基准美国配方

1 亿多扰动细胞训练,数据由 Tahoe、Parse 等外部生产

数据类型
单细胞扰动转录组

模型与发布

Arc Institute 2025-06 发布的扰动响应预测模型,含 SE 与 ST 两部分[1]。

训练数据配方

  • 公共库:SE 预训练用 1.67 亿观测人类细胞[1]。
  • 外部真值:ST 训练超 1 亿扰动细胞、70 多个细胞背景,大头是 Tahoe-100M(State 论文口径 1,138 条件、380 种药物,⚠️ 药物数与 Tahoe-100M 的 1,100+ 口径不一致),另有 Parse-PBMC(约 1,000 万细胞)与 Replogle-Nadig(2,024 个扰动、4 个细胞系,见 Perturb-seq(Replogle 2022))[1]。
  • 评测:2,102 种扰动、5 个数据集、40 个背景。蒸馏合成:无。

数据供应方与许可

Tahoe Therapeutics、Parse Biosciences、Replogle/Nadig 实验室;State 自己不产湿实验数据,属"外部真值厂商供数据" [1]。

已知问题与口径冲突

二手转述称独立基准中 State 比细胞均值好 26%,多个模型连线性基线都没打过;Arc 自称好 50%,均 ⚠️ 未回源。见 Arc Virtual Cell Challenge。

来源

  1. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.06.26.661135v1.full (2026-10-15)
  2. https://arcinstitute.org/news/arc-virtual-cell-atlas-launch (2026-10-15)

卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。