DockGen

内容与规模

DockGen 随 DiffDock-L 工作提出，按配体接触链的 ECOD 域切分训练/测试，用以检验对接模型对新口袋类型的泛化。数据集体系数未核到，省略。

真值来源与是否盲测

真值来自已发布复合物结构，回顾式切分；切分单位是结构域而非 PDB ID 或序列相似度，规避"序列低同一性但口袋近同"的陷阱 [1]。

谁用它发布结果、运营方角色

由 DiffDock 系列作者（美国学术团队）自建并报告结果，评测方与方法开发方同源。二手转述：在该切分下 DiffDock 类 ML 对接成功率仅 7.1%，DiffDock-L 提升到 22.6%（待复核）⚠️ [1]。

泄漏与缺陷

它暴露的是 PDBbind 式随机或序列切分下对接成功率被高估的问题，见 PDBbind / PDBbind+、数据泄漏（训练-测试泄漏）；与 PLINDER（相似度切分）、Runs N' Poses（时间切分加相似度分层）是互补的三种防泄漏思路。

来源

1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10925391/ (2026-10-15，二手转述)