Reactome

内容与规模

Reactome 由博士级审编者与编辑团队手工整理通路，人类通路是核心，其他物种经同源推断生成（二手）。API 实测当前版本为 97 [1]；通路数、反应数本次未核到。

格式与 license

提供 BioPAX、SBML、Neo4j 图库与 Web API。二手来源称注释文件（如 ID 映射、衍生互作数据）为 CC0，软件、代码与通路插图为 CC BY 4.0 [2]；官方许可页未直接核到 ⚠️。

哪些模型拿它训练或评测

通路富集分析的主流基因集之一；单细胞与扰动模型常以 Reactome/GO 通路做解释性或先验约束（二手，未逐篇核）。

已知偏差

覆盖由审编精力决定，已研究多的通路更完整；以人类为中心，其他物种多为推断；通路边界人为划定，同一过程在不同库里切分不同。与 KEGG 的许可差异显著：Reactome 更宽松。

来源

1. https://reactome.org/ContentService/data/database/version (2026-10-15)
2. https://www162.lamp.le.ac.uk/vocabularies/reactome (2026-10-15)