KEGG

数据集日本数据库

京都大学系通路与基因组知识库,批量下载需订阅

数据类型
通路图;KO 直系同源;基因;化合物;反应
规模口径
通路 587、KO 28,534、基因 68,181,939、基因组 11,949、化合物 19,666、反应 12,493(REST info 实测,2026-10-14 更新)
License
学术网页自由用;FTP 批量下载为付费订阅;商用需授权
链接
www.kegg.jp

内容与规模

KEGG 将通路图、基因(含 KO 直系同源分组)、化合物、酶与反应联在一起,长期是代谢与通路注释的事实标准。REST 实测规模见 frontmatter [1]。

格式与 license

版权归 Kanehisa Laboratories。学术用户可免费使用网站与 GenomeNet 镜像,FTP 整库仅限订阅,订购经 NPO Bioinformatics Japan 或 Pathway Solutions;非学术用途需商业授权 [2]。官方法律页最后更新为 2024-10。

哪些模型拿它训练或评测

通路富集与代谢网络分析广泛使用;因批量授权限制,开放权重模型的训练语料较少直接内置全库 KEGG(推断,未逐篇核)。

已知偏差

通路图是人工抽象,粗粒度且更新依赖少数团队;许可限制影响可复现性与再分发。开放替代见 Reactome。

来源

  1. https://rest.kegg.jp/info/kegg (2026-10-15)
  2. https://www.kegg.jp/kegg/legal.html (2026-10-15)

卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。