STRING

内容与规模

STRING 汇总实验、数据库、共表达、基因邻接与文献挖掘五类证据，给出蛋白间功能关联的综合打分。12.5 版含 12,535 个物种（细菌 10,756、真核 1,322、古菌 457）、59,309,604 个蛋白、28,464,487,748 条互作；置信度 ≥0.4 约 40.4 亿条，≥0.7 约 9.5 亿条，≥0.9 约 2.99 亿条 [1]。

格式与 license

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哪些模型拿它训练或评测

蛋白互作预测、图神经网络与网络药理学方法常以其作先验或标签；基因集富集与扰动建模也用它构图（二手，未逐篇核）。

已知偏差

"关联"不等于物理结合，含大量文献共现与同源转移；低置信边极多，需设阈值；研究热门蛋白边更密，造成度分布偏差；评测若用 STRING 标签，可能与同源库产生泄漏，见 数据泄漏（训练-测试泄漏）。

来源

1. https://string-db.org/cgi/about (2026-10-15)