BioEmu

工具与格式仿真

微软的蛋白构象系综生成模型,单 GPU 每小时数千构象

原理:Microsoft Research AI for Science,Science 2025-07。先在处理后的 AFDB 上预训练,再用大规模 MD 数据继续训练(摘要称 >200 ms,FU Berlin 稿称 >100 ms),再用 >50 万条实验稳定性数据微调 [1][2]。

代表实现与用户:单 GPU 每小时可生成数千个独立构象,称比 MD 少 1 万至 10 万倍 GPU 小时(公司口径)[1]。属"二代仿真",以一代 MD 计算为燃料(见 三代仿真框架)。

局限:依赖 AF2/AFDB 作"教师",上限受教师约束(见 AlphaFold DB 与结构蒸馏);MD 数据量口径 100–200 ms 不一致;⚠️ 未见独立第三方复核。

来源

  1. https://www.microsoft.com/en-us/research/blog/exploring-the-structural-changes-driving-protein-function-with-bioemu-1 (2026-10-15)
  2. https://www.fu-berlin.de/en/presse/informationen/fup/2025/fup_25_120-proteinmodellierung-bioemu-noe/index.html (2026-10-15)

卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”;⚠️ 为未经独立核实。