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DepMap

数据集美国数据库

Broad 的癌细胞系依赖性图谱，虚拟细胞模型常用评测真值

数据类型: CRISPR 依赖性；组学
规模口径: 季度发布，细胞系数量未查到
License: CC-BY-4.0（个别文件另有条款）
链接: depmap.org

内容与规模

DepMap（Cancer Dependency Map）由 Broad Institute 主导，自 2016 年起系统测定癌细胞系的基因依赖性（CRISPR、RNAi）并配套组学表征，按季度发布。具体细胞系数量未查到 [1][2]。

格式与 license

多数数据为 CC BY 4.0，个别文件另有 Broad 条款，使用时需逐文件核查 [1][2]。

哪些模型拿它训练或评测

DepMap 的 CRISPR 依赖性常作为虚拟细胞与扰动响应模型的评测真值或特征，与 scPerturb、Perturb-seq（Replogle 2022）类数据配合使用（此为归纳性描述，具体模型清单未逐一核）。

已知偏差与泄漏

细胞系不等于患者组织，培养环境和长期传代会改变表型；癌系集中在易培养的类型，覆盖偏向。季度版本之间的筛选批次和算法修正会改变数值，评测需固定版本。与 CCLE 组学数据同源，训练和评测若共用细胞系会产生泄漏。

来源

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卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”；⚠️ 为未经独立核实。