scPerturb
44 个公开单细胞扰动数据集的统一整理
- 成立
- 2022
- 数据类型
- 扰动单细胞转录组
- 规模口径
- 44 个公开数据集
- 链接
- pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
内容与规模
scPerturb 把 44 个公开单细胞扰动数据集统一处理并提供统一 schema，2022 预印本，2024 发表于 Nature Methods [1]。
格式与 license
采用 AnnData 格式（见 AnnData），各子数据集沿用原始来源条款，具体许可未逐一核 ⚠️。
哪些模型用
用于虚拟细胞模型的扰动响应评测与训练，常与 Perturb-seq（Replogle 2022）、DepMap 一同作为 reward 与验证数据；基准侧见 PerturBench。
已知缺陷
属于"重处理与统一 schema"型增值，不新增湿实验数据；各数据集扰动类型、细胞系、测序平台差异大，批次与标注质量不一。
来源
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卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”；⚠️ 为未经独立核实。