GROMACS
工具与格式仿真
开源 MD 引擎，ATLAS 数据集所用（v2019.6）
原理：开源分子动力学软件，广泛用于生物分子模拟。
代表实现与用户：ATLAS 使用 GROMACS 2019.6 与 CHARMM36m 力场，生成 1,390 条链各 3×100 ns 的轨迹 [1]。许可条款 ⚠️ 未核实。
局限：作为经典 MD 引擎，产出受力场与采样时间限制；与 OpenMM 同类，轨迹成本主要取决于算力而非软件授权（推断）。
来源
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卡片整理 2026-10-15。公司自报数据标“公司口径”；⚠️ 为未经独立核实。