OpenMM

原理：开源分子动力学引擎，可作为 MD 数据与力场开发的底层工具。许可条款 ⚠️ 未核实。

代表实现与用户：本站所引来源未提及 OpenMM 的具体用户或数据集。同类引擎见 GROMACS（ATLAS 所用）；ACEMD（mdCATH 所用）为另一款 GPU MD 引擎。

局限：MD 引擎本身受力场精度与可采样时间尺度限制，长时间尺度需专用硬件（如 D.E. Shaw 的 Anton 3，PSC 对非商业生物医学研究免费分配）或 BioEmu 一类学习式替代。